El Altar de San José se encuentra en la tercera capilla del lado derecho (segunda capilla del lado sur) desde el altar mayor, y corresponde arquitectónicamente al Altar de los Ángeles de la Guarda, ubicado en el lado opuesto. En 1716, reemplazó un antiguo altar dedicado a Santa Catalina y a los santos mártires. Fue construido gracias a una donación de 1000 ducados de oro hecha en 1709 al colegio jesuita por el maestro Joseph de Giorgio, quien en un principio había proyectado financiar dos altares, pero finalmente optó por encargar uno solo, más majestuoso, consagrado a su santo patrono.
Su arquitectura es claramente barroca: visualmente rica y espacialmente dinámica. Está realizado principalmente en mármol de colores e importado negro, y presenta esculturas en mármol blanco que crean un notable contraste. Dos columnas salomónicas sobre basamentos ondulados dominan la composición, acentuando la profundidad del conjunto. Estas columnas, junto con pilastras, sostienen un entablamento ornamentado y un ático enmarcado por volutas, coronado por una cartela con la inscripción “ITE AD IOSEPH”. La mesa del altar, de forma convexa, está decorada con motivos vegetales en forma de volutas y un medallón en relieve de San José con el Niño Jesús.
En la hornacina central, sobre la mesa del altar, se encuentra el cuadro La Muerte de San José, atribuido a Franz Karl Remb, de Radovljica, pintado hacia 1702 o 1710. A ambos lados del cuadro se alzan las esculturas de San Dimas (a la izquierda), el “buen ladrón”, y Santa Bárbara (a la derecha), ambos considerados intercesores por una buena muerte. Estas esculturas están firmadas con la fecha 1716 y fueron talladas por el célebre escultor veneciano Angelo de Putti. Por encima de la pintura principal se encuentran dos cabezas de ángeles y dos fruchtorns (motivos ornamentales vegetales), y en el ático, un relieve en bajorrelieve de Los desposorios de la Virgen María, flanqueado por ángeles arrodillados con las alas desplegadas (parcialmente truncados por razones espaciales). En la mesa del altar también se halla una pintura del Sagrado Corazón de Jesús, obra de Josef Plank, realizada en 1860.
Todas las esculturas son sin lugar a dudas obra de Angelo de Putti, quien influyó decisivamente en el estilo escultórico barroco en Carniola. Incluso si la ejecución final del altar hubiese estado a cargo de otro maestro (posiblemente Francesco Robba o Luka Mislej), es muy probable que de Putti haya desempeñado un papel esencial en su diseño.
San José, esposo de María y padre adoptivo de Jesús, recibió una creciente veneración desde finales del siglo XVII, especialmente gracias a la labor de los jesuitas. En 1870, el papa Pío IX lo proclamó Patrono de la Iglesia Universal. Posteriormente, en 1955, el papa Pío XII instituyó la fiesta de San José Obrero, celebrada el 1 de mayo, subrayando su vínculo con la dignidad del trabajo.
Santa Bárbara (fiesta: 4 de diciembre), mártir del siglo III, es patrona de los mineros, arquitectos y de los moribundos. San Dimas (fiesta: 25 de marzo), es recordado como el ladrón arrepentido crucificado junto a Jesús, quien exclamó: “Señor, acuérdate de mí cuando llegues a tu Reino”.
